Согласно археологическим данным, впервые ислам на территории Сибири появился в XII веке. Археологами были найдены могилы кочевников кыпчаков, которые подверглись исламизации под воздействием государства Хорезмшахов. Однако захоронения носили сезонный характер: кочевники приходили в юго-западную Сибирь лишь летом.
Исламизация населения Сибири начинается в XIV веке, и связана она была в первую очередь из-за контроля территории Золотой Ордой. На месте раскопок сибирских городищ периода Золотой Орды было найдено множество серебряных ордынских монет и зеркал.
Финальный этап исламизации региона происходит при хане Кучуме. Хан выписал из Центральной Азии мусульманских учёных, которые вели миссионерскую деятельность в Сибирском ханстве.
